Kotokartanosäätiön hallintoelimiä ovat säätiön valtuuskunta ja hallitus.
Valtuuskunta tukee säätiön toimintaa. Valtuuskunnassa on 6 – 8 jäsentä. Valtuuskunta valitsee hallituksen jäsenet ja täydentää itse itseään. Valinnoissaan valtuuskunta huolehtii, että hallituksessa on laaja-alaista ja monipuolista osaamista. Valtuuskunnan jäsenen toimikausi on 3 kalenterivuotta.
Säätiön asioita hoitaa ja sitä edustaa hallitus. Hallitukseen kuuluu 5 valtuuskunnan valitsemaa jäsentä. Hallituksen jäsenen toimikausi on 3 kalenterivuotta.
Hallituksen jäsenet 2022-2023
Raninen Jarno pj
Yrjö-Koskinen Aarno
Aittola Eija
Latvala Eira
Runsamo Seppo
Valtuuskunnan jäsenet 2020-2023
Lahdensalo Sirpa pj
Ilonen Sointu
Jokinen Päivi
Kemiläinen Eero
Kuparinen Veli-Pekka
Pahkala Ritva
Saraneva Usko
Viherä Sirpa